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1997年12月8日，36位港區全國人大代表經選舉順利產生，他們在1998年3月首次獨立組團出席全國人民代表大會，參與國是，參政議政。
1999年 1月30日 全國人大常委會通過關于香港特區九屆全國人大代表辭去代表職務的辦法的決定。
2001年3月5日，國家主席江澤民、全國人大常委會委員長李鵬、全國政協主席李瑞環在人民大會堂會見出席九屆全國人大四次會議的港澳特區全國人大代表。
2002年3月8日，國務院總理朱镕基看望港澳界全國政協委員，聽取意見。朱镕基指出，香港特別行政區和澳門特別行政區成立以來，“一國兩制”、“港人治港”、“澳人治澳”、高度自治的方針得到貫徹落實，向世人展示了“一國兩制”實踐的成功。目前港澳的形勢總體是好的，中央政府對兩個特別行政區的工作是滿意的。港澳政協委員為港澳的社會穩定和經濟發展做了很大貢獻，希望繼續支持行政長官和特別行政區政府的工作，維護港澳的長期繁榮穩定。
2003年6月30日，國務院總理溫家寶在香港會見部分香港特區全國人大代表、全國政協委員。
2011年4月23日，溫家寶邀請曾連續當選第四屆至第十屆全國人大代表的吳康民到中南海做客。
2005年3月12日，全國政協十屆三次會議增選董建華為全國政協副主席。
2008年3月，董建華當選第十一屆全國政協副主席。2013年3月，中國人民政治協商會議第十二屆全國委員會第一次會議舉行全體會議，董建華再次當選政協副主席。
2006年10月28日，全國政協副主席霍英東在北京逝世。受中央委托，全國政協副主席王忠禹，全國政協副主席、國務院港澳事務辦公室主任廖暉，全國政協副主席、中共中央統戰部部長劉延東，全國政協副主席董建華參加悼念儀式。全國政協副主席、治喪委員會主任王忠禹致悼詞。
2006年11月7日，在香港殯儀館舉行霍英東悼念和公祭儀式，霍英東的靈柩覆蓋著中華人民共和國國旗。
2006年2月，梁愛詩出任全國人大常委會香港特別行政區基本法委員會副主任。
2008年9月30日，范徐麗泰正式卸任香港立法會主席，就任港區全國人大常務委員會委員。
2008年3月6日，國家主席胡錦濤在北京人民大會堂會見出席十一屆全國人大一次會議和全國政協十一屆一次會議的香港、澳門地區全國人大代表、全國政協委員。胡錦濤要求香港特別行政區、澳門特別行政區的全國人大代表、全國政協委員既要積極參與國是，更要積極為“一國兩制”在香港、澳門的成功實踐貢獻力量。香港、澳門回歸以來的事實充分證明，“一國兩制”、“港人治港”、“澳人治澳”、高度自治的方針是完全正確的，香港同胞、澳門同胞完全有智慧、有能力管理好、建設好香港、澳門，偉大祖國永遠是香港、澳門繁榮穩定的堅強后盾。
2011年6月22日，中共中央政治局常委、國家副主席習近平在北京人民大會堂親切會見港區省級政協委員聯誼會訪問團全體成員。習近平對港區省級政協委員聯誼會訪問團表示歡迎。他說，港區省級政協委員聯誼會成立以來，高舉愛國愛港旗幟、團結香港各界人士、有力支持了行政長官和特別行政區政府依法施政；積極組織港區省級政協委員參政議政、投身內地改革開放和現代化建設、促進了香港與內地交流合作；同時，也為加強與臺灣島內聯系、反對“臺獨”分裂勢力、推動祖國和平統一進程作出了自己的貢獻。
2012年3月4日，中共中央政治局常委、國家副主席習近平看望港澳地區全國政協委員，并參加討論。習近平希望港澳地區全國政協委員圍繞國家大局和港澳長期繁榮穩定，更加積極主動地為國家發展建言獻策，更加積極主動地參與港澳社會政治事務，更加團結地維護港澳社會和諧穩定，積極推動社會各方面顧全大局、理性溝通，進一步促進包容共濟、和諧穩定。
2012年12月9日，香港特別行政區第十二屆全國人大代表選舉會議主席團在香港舉行第二次會議。主席團經過審查，確認送交登記表的52人符合代表候選人條件，為香港特別行政區第十二屆全國人大代表候選人。主席團常務主席梁振英主持會議。
2012年12月19日，香港特別行政區第十二屆全國人大代表選舉會議第二次全體會議,選舉產生了36名香港特別行政區第十二屆全國人大代表。受全國人大常委會委托前來香港主持選舉工作的全國人大常委會副委員長兼秘書長李建國出席會議
2013年6月29日，全國人大常委會委員長張德江在人民大會堂向全國人大常委會第四屆香港特別行政區基本法委員會12名組成人員頒發任命書。
2014年5月22日，中共中央政治局常委、全國政協主席俞正聲在北京會見香港特區省級政協委員聯誼會訪京團。俞正聲表示，港區政協委員要自覺擔當責任，做香港和內地交流交往的紐帶，為增進兩地交流和理解獻計出力；聯誼會要密切保持與內地政協組織之間的聯系，支持政協的各項工作，多提意見建議，為國家經濟社會發展、為人民政協事業的發展多作貢獻。
2014年5月23日，國務委員楊潔篪在清華大學出席了“香港特區政府高級公務員國家事務課程20周年紀念大會”。楊潔篪在講話中對過去20年港澳公務員國情培訓工作所取得的成就予以充分肯定，并希望在今后的培訓中進一步增加對“一國兩制”方針和基本法及國家發展方略的學習，以提高港澳公務員全面、準確地理解和貫徹“一國兩制”方針和基本法的能力，讓港澳公務員更加全面、深入了解國家整體形勢，把握未來發展的大勢，為“一國兩制”的成功實踐作出積極貢獻。
2014年8月21日，全國人大常委會辦公廳在深圳召開“香港特別行政區政制發展座談會”，就十二屆全國人大常委會第十次會議即將審議的《關于香港特別行政區2017年行政長官及2016年立法會產生辦法是否需要修改的報告》聽取了香港特區人大代表和政協委員等方面人士的意見。
2015年9月10日，由全國政協副主席董建華、李海峰率領的香港特區全國政協委員考察團抵達黑龍江省，就“中蒙俄經濟走廊”黑龍江陸海絲綢之路經濟帶（簡稱“龍江絲路帶”）專題開始為期四天的考察。
2016年10月9日至17日，香港特別行政區第十二屆全國人大代表赴四川成都、德陽、雅安、涼山等地開展為期9天的視察。代表、委員們通過視察等方式，認真履職，積極建言獻策。
2016年3月3日，全國政協主席俞正聲在全國政協十二屆四次會議報告中表示，要鼓勵港澳地區政協委員發揮雙重作用。俞正聲指出，全面準確貫徹“一國兩制”、“港人治港”、“澳人治澳”、高度自治方針，嚴格依照憲法和基本法辦事，支持特別行政區行政長官和政府依法施政，鼓勵港澳地區政協委員發揮雙重積極作用，為促進內地與港澳合作發展獻計出力，廣泛深入地參與港澳青少年工作。
2017年3月6日，中共中央政治局常委、全國人大常委會委員長張德江參加十二屆全國人大五次會議香港代表團審議。張德江指出，黨的十八大以來，在以習近平同志為核心的黨中央堅強領導下，國家各項事業都取得了可喜成績，“一國兩制”實踐取得新進展。今年是香港回歸祖國20周年，香港社會要進一步全面準確貫徹“一國兩制”方針和基本法，保持香港社會政治穩定、經濟繁榮。希望香港依法順利選出符合中央要求的新一任行政長官人選。
2017年4月7日，香港中華總商會及香港友好協進會共同舉辦解讀“兩會”論壇。邀請部分在港全國人大代表和政協委員圍繞今年“兩會”內容與成果、中國經濟未來發展、一帶一路建設新舉措，以及香港的機遇和發展等議題展開充分有效的研討。
